1．主体教育理论研究的定位问题。
立足于现代教育的高度，从哲学角度反思现代教育的各种问题；关照教育改革的方向，确立新的教育观念，为素质教育的实施提供一种新的理论框架；寻求促进青少年儿童生动活泼主动发展的基本途径。
2．主体教育的理论基础--马克思主义关于人的发展学说。
马克思主义关于人的发展理论从哲学、政治经济学、社会主义学说等不同方面进行了论述，基本观点是；人是劳动基础上形成的社会化的高级动物，是社会历史活动的主体，区别于其他动物，人具有主动性、自主性、社会性、抽象思维能力以及高度创造性等基本属性。马克思对人的本质的分析，突出了人的社会历史性与自觉能动性的特点。主体性，是人的本质的最高层次，是全面发展的人的根本特征。
3．主体教育理论的若干命题。
（1）学生主体性发展是培养全面发展的人的基础和核心。
（2）学生作为发展的主体，是具体的、活生生的、有丰育个性的、不断发展的认识主体，是具有主观能动性的独立个体和群体。
（3）主体性，作为主体的本质属性，是主体在同个体的相互作用中表现出来的能动性，不是实存住，而是功能性。既包括人对世界的自觉能动的掌握，也包括人对世界的自觉能动的创造。自主性、主动性和创造性是学生主体性的内在规定性。
（4）“实践是人特有的存在方式”，主体性是实践主体的个性。学生的主体性在活动中生成，在活动中发展，在活动中表现。应坚持活动的客观性、目的性、群体性及创造性。
个体在群体交往中得到发展，通过合作与交往，促进学生主体性发展。
主体间性，主体与主体间的相互交往的特性，是人的主体性的重要组成部分。通过主体在群体中的交往，在交往中人自身才能得到发展，人的主体性才能得以真正的实现。
（5）学生主体性发展的基本条件。主体素质结构--思想品德发展水平、成就动机、知识结构、智力水平、身体素质、活动能力、科学方法、人格特征等内在因素决定学生主体性水平及其发展。学校教育及良好的社会环境提供主体性发展的重要条件。
（6）要发挥学校教育的主导作用，应处理好主体性与客体性的关系，主体性与实践活动的关系，个体主体性与群体主体性的关系，自主、主动与创造的关系。揭示主体性的实践基础，主体间性的特点、主体性的内涵及发展机制，以及主体性在人的依赖性--奴役性--个性充分自由发展三个阶段中的作用。
主体教育教学系统的构建是九年研究的主要内容，也是取得成效最显著的部分。围绕主体教育教学系统的构建，主要探讨了以下问题：1．学科教学中主体性发展的目标；2.体现主体性发展的课程结构；3．课堂教学中发展学生主体性的教学策略；4．影响课堂教学主体性发展的主要因素；5．课堂教学组织形式的改革与学生主体性发展；6．主体性课堂教学质量评估问题。经过理论研究及积极的实践探索，主体教育教学系统的研究主要进展表现在以下三个方面。
1．发展性教学策略体系的形成。
教学策略作为一种依据一定教学理论，为实现一定教学目的而采取的教学方式，区别于教学方法，它追求的是一种境界，具有综合性、变通性和创造性。
体现主体教育的发展性教学，是在现代教学观念指导下，以学生为主体，通过学生主动学习促进主体性发展的一种教学思想和教学方式。发展性教学策略关注教学观念的转变，且呈现丰富多样的特点。
经过九年实验研究，初步构建了发展性教学的四个基本策略：（1）主体参与；（2）合作学习；（3）差异发展；（4）体验成功。
2．集体教学、小组合作学习及个别辅导相结合的新教学形式的探索。
小组合作学习，作为一种新的教学观念与策略，以异质小组为基本形式，以小组成员合作性活动为主体，强调小组目标达成及小组总体成绩评价和奖励，以利于学生合作意识、合作技能的培养。